黎老堂主(王永泉 飾)施猛藥治療瘟疫，卻百密一疏漏了解除肺火導(dǎo)致新藥方不見效果。蕭平旌(劉昊然 飾)誤打誤撞的為了給林奚(張慧雯 飾)煮水止渴，用泡水的小紅果解了肺火，不但救下了林奚的性命，也使得新藥方終于完美無缺，以此抓藥，濟(jì)風(fēng)堂內(nèi)的病人紛紛好轉(zhuǎn)。太醫(yī)(郝文學(xué) 飾)署聽得消息，連忙親自找到黎老堂主，老堂主以經(jīng)驗(yàn)判斷，新藥方效果顯著，除了體質(zhì)過弱或者已經(jīng)危重的患者，十之八九都可以痊愈。太醫(yī)激動(dòng)不已，迅速將藥方帶走，推廣開來，一場(chǎng)差一點(diǎn)毀滅整個(gè)帝都的瘟疫危機(jī)，就此在蕭平旌的無心之舉有了轉(zhuǎn)機(jī)。

蕭元啟(吳昊宸 飾)坐在自家的侯府中捏著她母親的遺書，他暗自發(fā)誓自己絕對(duì)不會(huì)被人當(dāng)作一個(gè)棋子操控，渾渾噩噩的度過一生，他決定要走上一條他母親連想都沒有想過的道路上去。所以先決定來找蕭平章(黃曉明 飾)。雖然疫情得到了控制，但蕭平章還是提醒巡防營絕對(duì)不能放松警惕，對(duì)京城之中的各個(gè)關(guān)鍵區(qū)域都要嚴(yán)加防范，他見的蕭元啟來找他頗為驚訝，知道蕭元啟定有什么特別的事。蕭元啟則稱有一樣?xùn)|西給蕭平章看。

林奚的身體一點(diǎn)點(diǎn)康復(fù)，令蕭平旌安心不少，不過他還是不想讓林奚太過操勞。林奚卻知道新藥方中最重要的一味藥是白茵草，她突然想起之前有人曾大量收購過白茵草，想必此時(shí)藥房醫(yī)館之中定還沒有補(bǔ)齊存貨。蕭平旌聽林奚介紹此藥草既不稀有，也不常用，沒有囤積價(jià)值，和林奚一同察覺到其中定有內(nèi)情。

蕭元啟原來是給蕭平章看了她母親的遺書。他明言此遺書是由濮陽纓(郭京飛 飾)轉(zhuǎn)交，而他母親當(dāng)年所做之事，背后都有著濮陽纓的慫恿和教唆。他哽咽著表示，若非濮陽纓的乾天院被查封，他直到此時(shí)都不敢登長(zhǎng)林王府的大門。坦言濮陽纓之所以交給他這封遺書，就是希望可以像操縱他母親一樣，挑起他心中的仇恨而繼續(xù)操縱他。蕭平章看出蕭元啟給他看的遺書并不完整，而是截取的部分。蕭元啟稱他沒拿出來那些都是她母親的抱怨之詞，他不愿再看第二遍，就都給燒了。他接著道今日并非用濮陽纓給他母親開脫，而是另有原因，并將他通過跟蹤，記住了濮陽纓幾個(gè)手下的事告訴了蕭平章，且其中兩人就在城中。此時(shí)，蕭平旌也報(bào)告給他哥白茵草的事，蕭平章先略略安排了一下處置方法之后，叫蕭平旌和蕭元啟一道去將濮陽纓的那兩個(gè)手下捉拿歸案。兩人來到那兩個(gè)濮陽纓手下的落腳點(diǎn)，前后堵住來去路。那兩名手下還想逃跑，被蕭平旌和蕭元啟輕松活捉。然而還未等他們審問幾句，那兩名手續(xù)下便自殺身亡了，不過蕭平旌卻敏銳的發(fā)現(xiàn)了兩人身上的秘密紋身。

太醫(yī)院經(jīng)過試驗(yàn)，證實(shí)了黎老堂主新藥方的效果，這才敢送到宮中。內(nèi)廷官一路小跑的將方子送到了荀白水(畢彥君 飾)的手上，他和荀飛盞(張博 飾)聽說太子有救了，俱是興奮異常?；屎笞谔拥拇策叢恢蚰穆飞裣啥\告，但心意定然是虔誠無比，太子在新藥方的治療之下，終于有了好轉(zhuǎn)悠悠蘇醒。

白茵草的事確實(shí)非常棘手，荀白水將太醫(yī)署和黎老堂主叫到一處商議，眾人算出白茵草存量只能維持控制瘟疫，若要根治瘟疫，還需要在半個(gè)月內(nèi)籌措兩倍的白茵草進(jìn)城才行。然而該怎么向城外求救便成了問題，因?yàn)槿魏稳硕伎赡苋居形烈呱形窗l(fā)作，一但出城將瘟疫帶到城外則前功盡棄。此時(shí)黎老堂主便推薦他的徒弟杜掌柜，并坦言得過此瘟疫并痊愈的人，便不會(huì)再得，更不會(huì)傳染，，而杜掌柜正是當(dāng)年幸存下來的夜秦人之一。

蕭平旌越看濮陽纓手下的紋身越熟悉，想起他曾經(jīng)在段桐舟(邢岷山 飾)的身上見過同樣的紋繡，立即找來荀飛盞和蕭平章商量。但蕭平章卻認(rèn)為，并不能推斷濮陽纓的心腹手下都有這個(gè)紋身，不過也可以斷定，有這個(gè)紋身的人肯定和濮陽纓有所關(guān)聯(lián)。但紋繡在衣服之下，不好排查。荀飛盞和蕭平旌還一同覺得這個(gè)紋繡在段桐舟之前他們也隱約見過，卻想不起來。蕭平章勸兩人此時(shí)還是先以疫情為重，其他的事還沒有更多發(fā)現(xiàn)之前，就先記下來再說。

有人進(jìn)入天牢刺殺京兆尹李固(馮千 飾)，荀飛盞也在此時(shí)來查探李固，刺殺者躲在了隔壁。荀飛盞雖然察覺到李固的表情很是怪異，但卻沒看出更多端倪。就在他思索間，卻聽到太子蘇醒的消息，便匆匆趕回了皇宮。而李固就這樣被刺殺者活活勒死，并做成了他畏罪自殺，上吊身亡的樣子。

衛(wèi)山羽林營副統(tǒng)領(lǐng)葛鵬押運(yùn)五車藥草回金陵救濟(jì)，巡防營放下繩索將藥草拉入了城中，躲在山洞里的濮陽纓因?yàn)樽约旱挠?jì)劃失敗而惱怒不已。他本以為這個(gè)時(shí)候城中該時(shí)才發(fā)現(xiàn)白茵草不夠才對(duì)，奇怪為何第一批補(bǔ)給如此之快的就到了。他只能幻想著城里的手下能聰明點(diǎn)，早點(diǎn)下手，卻不知那兩人已死去多時(shí)了。

補(bǔ)給藥草送到，城中瘟疫終于得到了有效的控制，所有的醫(yī)館都忙的焦頭爛額，濟(jì)風(fēng)堂尤甚。蕭平旌對(duì)濮陽纓手下的紋身很感興趣，先讓林奚幫忙辨識(shí)一下。然而卻被對(duì)方以太過忙碌冷冷拒絕。蕭平章在書上查到那些紋秀原來是墨楨花圖案。

荀飛盞得到了李固身死的消息后，對(duì)此事深感懷疑，來到天牢詳查，卻也發(fā)現(xiàn)不了什么蹤跡。第三批次藥草送到，但金陵城還是緊閉不開，濮陽纓的得不到任何消息，不過他現(xiàn)在最關(guān)心的卻是濟(jì)風(fēng)堂里的云姐(張棪琰 飾)，并稱如果她沒有得手，下一步就不好走了。他回憶起小時(shí)候的事，原來那墨楨花紋繡正是夜凌學(xué)宮的標(biāo)記。